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OpenAlea, une plateforme libre pour la modélisation des plantes

CIRAD, UMR DAP & INRIA, Virtual Plants
on 2010/09/03 at 11:00

Summary

Modéliser la croissance et le fonctionnement des plantes nécessite d'intégrer une grande variété de connaissances scientifiques et techniques et de gérer un volume de données de plus en plus important. Pour pouvoir valider des hypothèses biologiques en utilisant des modèles structure-fonction de plantes (Functional Structural Plant Model), il devient essentiel de partager l'expertise de différents groupes afin:

- d'acquérir et d'analyser des données hétérogènes,

- de simuler la croissance de plantes en intégrant différents processus agissant à différentes échelles,

- d'effectuer des pré- et post-traitements par exemple d'analyse statistique ou de visualisation.

Nous présenterons la plateforme de modélisation OpenAlea et son environnement de programmation visuelle. Dans un premier temps nous présenterons l'architecture de la plateforme. Ensuite, nous présenterons différents modèles intégrés dans la plateforme et illustrerons les fonctionnalités majeures à travers des démonstrations. Nous conclurons en présentant comment chaque modélisateur peut intégrer et mettre à disposition son modèle ou ses données et annoncerons les prochaines formations.