- by Christophe PradalOpenAlea, une plateforme libre pour la modélisation des plantes
A seminar devoted to plant modeling is organized the first Friday of each month at 11h at the Agropolis amphitheatre (see here for the access).
Feel free to contact us for proposing a presentation, suggesting a speaker or a scientific theme of interest.
Next event
OpenAlea, une plateforme libre pour la modélisation des plantes
Summary
Modéliser la croissance et le fonctionnement des plantes nécessite d'intégrer une grande variété de connaissances scientifiques et techniques et de gérer un volume de données de plus en plus important. Pour pouvoir valider des hypothèses biologiques en utilisant des modèles structure-fonction de plantes (Functional Structural Plant Model), il devient essentiel de partager l'expertise de différents groupes afin:
- d'acquérir et d'analyser des données hétérogènes,
- de simuler la croissance de plantes en intégrant différents processus agissant à différentes échelles,
- d'effectuer des pré- et post-traitements par exemple d'analyse statistique ou de visualisation.
Nous présenterons la plateforme de modélisation OpenAlea et son environnement de programmation visuelle. Dans un premier temps nous présenterons l'architecture de la plateforme. Ensuite, nous présenterons différents modèles intégrés dans la plateforme et illustrerons les fonctionnalités majeures à travers des démonstrations. Nous conclurons en présentant comment chaque modélisateur peut intégrer et mettre à disposition son modèle ou ses données et annoncerons les prochaines formations.
History
- by Alain TrubuilReconstruction et analyse comparative d'embryons d'Arabidopsis observés en microscopie confocale
- by Gaëtan LouarnContribution de la modélisation architecturale au phénotypage de la réponse au froid du maïs
- ...